Sekolah Tinggi Teologi Agathos (STT Agathos) didirikan pada tanggal 24 Juli 1995 di bawah naungan Yayasan Agathos Indonesia. Sejak awal berdirinya, STT Agathos berkomitmen untuk melaksanakan Amanat Agung Tuhan Yesus Kristus (Matius 28:18-20) melalui pendidikan teologi yang unggul.